抗ssDNA的测定结果缺乏疾病特异性，除SLE患者有较高检出率(50%～60%)外，其他风湿病如混合性结缔组织病(mixel connective tissue disease，MCTD)、药物诱导的狼疮、硬皮病、皮肌炎、干燥综合征，类风湿性关节炎等也都有10%～70%的检出率。当抗dsDNA阴性而SLE的诊断尚未明确时，高滴度抗ssDNA的存在对诊断也有参考意义。由于很多SLE患者血清中存在的抗DNA抗体能同时与dsDNA和ssDNA反应，表明二者有相同的抗原表位，因而有人认为，不能排除抗ssDNA也有致病作用，甚至导致肾脏病变的可能。