1.抗scl-70抗体：在系统性硬化症患者中，抗Scl-70抗体阳性率为40％～60％。由于在其他风湿性疾病患者的血清中很少出现抗Scl-70抗体，故通常认为它是系统性硬化症的血清标志性抗体。
2.抗着丝点抗体：抗着丝点抗体(ACA)为局限型SSc的标记抗体，可见于50％～96％的局限性硬皮病。在弥漫性硬皮病患者中，抗着丝点抗体的阳性率仅为10％。临床上由于局限型和弥漫型系统性硬化症难以区分，可通过该抗体来鉴别。特别在CREST综合征抗着丝点抗体阳性率高达98％，因而一般认为该抗体是局限型SSc的变种CREST综合征的标记抗体。该抗体可较早出现于患者血清中，临床研究发现，抗着丝点抗体与血管炎、肺受累有关，不随病情变化而波动，而且多提示预后相对较好。
3.抗PM-Scl抗体：抗PM-Scl抗体多见于系统性硬化症。而在系统性硬化症、多发性肌炎重叠伴肾炎患者中阳性率可高达80％。
4.抗核仁抗体：抗核仁抗体出现在30％～40％系统性硬化症患者，特别在弥漫型系统性硬化症患者阳性率高。
5.抗RNP聚合酶抗体：抗RNP聚合酶抗体是SSc的主要抗体之一。抗RNP聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ抗体三种类型均阳性者弥漫性皮肤硬化的发生率增加，肾受累的发生率也明显升高。至今，抗RNA多聚酶Ⅰ仅见于进行性系统性硬化症(硬皮症)，但其发生率低，约为4％。
6.抗内皮细胞抗体：抗内皮细胞抗体(AECA)是SSc一个较为重要的抗体，与雷诺现象、毛细血管扩张、显著的指端局部缺血的高发生倾向有关，与外周血管病变有关，并成为是否有内皮细胞损伤的一个标志，而与皮肤硬化类型、抗Scl-70抗体、MCA和SSc的一些临床表现如心、肺、肾、食管累及，钙沉积及干燥综合征的发生无关。
7.抗核抗体：70％的系统性硬化症患者抗核抗体可阳性。ANA还可见于多种风湿免疫性疾病。
8.系统性硬化症患者血沉大多正常或轻度升高；约50％系统性硬化症患者有低滴度的冷球蛋白血症；约1／3系统性硬化症患者类风湿因子可阳性。系统性硬化症患者可检出抗心磷脂抗体，阳性率约为16％～21％。 9.抗组蛋白抗体(AHA):抗组蛋白抗体可在多种自身免疫性疾病(DIL、SLE、RA、SSc)中出现，对本病不具特异性诊断价值。该抗体在SSc中阳性率占20％以上并与弥漫性SSc的严重肺纤维化相关联，而在局限型硬皮病总阳性率为约42％。