1.约半数病例血沉增快。急性期或心肌炎活动期血清CK-MB、血清心肌肌钙蛋白T、肌钙蛋白I检测对心肌损伤的诊断具有较高的特异性和敏感性，后者检测时间窗较宽，其定量检查有助于心肌损伤范围和预后的诊断。ALT检查有助于发现肝损害，结合病原学检查结果可以诊断肝炎、病毒性心肌炎。
2.抗原抗体检测：检测柯萨奇和埃可病毒特异性IgG、IgM抗体。根据抗原不同，有肠道病毒（COX，ECHO，脊髓灰质炎，肠道病毒70/71）筛查与分型试剂，总肠道病毒混合试剂，柯萨奇病毒B组混合型试剂，埃可病毒混合型试剂，柯萨奇病毒（A9，24，B1，2，3，4，5，6型）筛查与分型试剂，埃可病毒（4，6，9，11，30型）筛查与分型试剂，肠道．病毒（70，71型，COXA16）筛查与分型试剂，柯萨奇病毒A9型，柯萨奇病毒A24型（埃可34），柯萨奇病毒D1-6各亚型，艾柯病毒4、6、9、11、30型。
3.用Real-time定量PCR检测外周血病毒RNA。