PCR扩增检测HSV-DNA适用于早期检测诊断，具有极高的敏感性和特异性。有免疫缺陷的患者血清学实验可阴性，临床表现亦不典型，PCR检测HSV-DNA尤其重要。现已有报告用荧光定量PCR法(FQ-PCR)定量检测脑脊液中HSV-DNA，由于采用荧光技术和闭管检测，避免了交叉污染；同时采用实时检测技术，所得值和原始模板数量完全呈线性相关，定量准确率极高。为临床实验室确定HSV感染提供了可靠的技术保证。FQ-PCR对HSE的临床诊断、治疗方案选择、提高疗效、防止复发有较大指导意义。