HBsAg是HBV感染的标志，可作为乙肝的早期诊断和普查。在急性肝炎潜伏期即可出现阳性，先于临床症状及肝功能试验异常1～7周。由于 HBsAg常和 HBV同时存在，故血清中HBsAg阳性，常被看作有传染性。但严格来说，HBsAg本身不是传染性的标记，因此，乙型肝炎病毒体HBsAg阳性者，应同时检测血清中HBV-DNA，如HBV-DNA阳性，应被视为病人有传染性。HBsAg的检测目前普遍用作献血员的筛选方法。如献血员血清中HBsAg阳性，应禁止献血。HBsAg的检测还被用于孕妇的产前检查。对HBsAg阳性产妇所生新生儿进行乙肝疫苗接种，防止发生母婴传播。
　　同时出现HBsAg和抗-HBs，可能是不同亚型重复感染，即原先存在的抗-HBs不能对另一型HBsAg起中和作用。