目前认为抗-Pre S2是HBV的中和抗体，有清除病毒作用。抗-Pre S2在急性乙肝恢复早期出现，并发挥其保护性抗体的作用。在急性乙肝中，Pre S2在病毒被清除前转换成抗-Pre S2，而在趋向慢性的病程中，则检测不到这种抗体。故抗-Pre S2是观察乙型肝炎进展、预后的观察指标。